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13817140470更新時間:2020-09-10 瀏覽次數(shù):2218
經(jīng)常提質(zhì)粒嗎?熟練之后,提質(zhì)粒乃至質(zhì)粒構(gòu)建都很簡單。但是質(zhì)粒圖譜你真會看嗎?小編這里有秘訣,免費分享給大家。
第yi步:首先看 Ori 的位置,了解質(zhì)粒的類型(原核/真核/穿梭質(zhì)粒)。
第二步:再看篩選標記,如抗性,決定使用什么篩選標記。
Ampr 水解β-內(nèi)酰胺環(huán),解除氨芐的毒性。
tetr 可以阻止四環(huán)素進入細胞。
camr 氯霉素羥乙?;苌?,使之失去毒性。
neor(kanr)氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶 使 G418(長那霉素衍生物)失活
hygr 使潮霉素β失活。
第三步:看多克隆位點(MCS)。它具有多個限制酶的單一切點。便于外源基因的插入。如果在這些位點外有外源基因的插入,會導(dǎo)致某種標志基因的失活,而便于篩選。決定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。
第四步:再看外源 DNA 插入片段大小。質(zhì)粒一般只能容納小于 10Kb 的外源 DNA 的片段。一般來說,外源 DNA 的片段越長,越難插入,越不穩(wěn)定,轉(zhuǎn)化效率越低。
第五步:是否含有表達系統(tǒng)元件,即啟動子-核糖體結(jié)合位點-克隆位點-轉(zhuǎn)錄終止信號。這是用來區(qū)別克隆載體與表達載體??寺≥d體中加入一些與表達調(diào)控有關(guān)的元件即成為表達載體。選用那種載體,還是要以實驗?zāi)康臑闇世K。
啟動子-核糖體結(jié)合位點-克隆位點-轉(zhuǎn)錄終止信號
啟動子-促進 DNA 轉(zhuǎn)錄的 DNA 順序,這個 DNA 區(qū)域常在基因或操縱子編碼順序的上游,是 DNA 分子上可以與 RNApol 特異性結(jié)合并使之開始轉(zhuǎn)錄的部位,但啟動子本身不被轉(zhuǎn)錄。
增強子/沉默子-為真核基因組(包括真核病毒基因組)中的一種具有增強鄰近基因轉(zhuǎn)錄過程的調(diào)控順序。其作用與增強子所在的位置或方向無關(guān)。即在所調(diào)控基因上游或下游均可發(fā)揮作用。/沉默子-負增強子,負調(diào)控序列。
核糖體結(jié)合位點/起始密碼/SD 序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA 有核糖體的兩個結(jié)合位點,對于原核而言是 AUG(起始密碼)和 SD 序列。
轉(zhuǎn)錄終止順序(終止子)/翻譯終止密碼子:結(jié)構(gòu)基因的zui后一個外顯子中有一個 AATAAA 的保守序列,此位點 down-stream 有一段 GT 或 T 富豐區(qū),這 2 部分共同構(gòu)成 poly(A)加尾信號。結(jié)構(gòu)基因的zui后一個外顯子中有一個 AATAAA 的保守序列,此位點 down-stream 有一段 GT 或 T 富豐區(qū),這 2 部分共同構(gòu)成 poly(A)加尾信號。
為什么質(zhì)粒圖譜上有的箭頭順時針有的箭頭逆時針?那其實是代表兩條 DNA 鏈,即質(zhì)粒是環(huán)狀雙鏈 DNA,它的啟動子等在其中一條鏈上,而它的抗性基因在另一條鏈上。
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